Program używa 39 baz, które zajmują około 300 MB miejsca na dysku twardym (razem z bazami archiwalnymi) i znajdują się w formie plików w katalogu Bazy. Znajdują się tam następujące bazy: akcjonariusze, bilans_hold5, bilanse5, dywidendy, emisje, linie5, gielda5, historia5, kwartal_hold5, kwartalne5, notowania_biez5, portfele5, prognoz_hold, prognozy, rozne5, transakcje5, wspolczynniki_biez, wspolczynniki_hold_biez. Oprócz tego program posługuje się 5 bazami tekstowymi zawartymi w katalogach: PlikiAT, PlikiFI, PlikiMst, PlikiRtf i PlikiZgr. Dodatkowo możliwości programu można rozszerzyć o 3 bazy historyczne: notowania_arch5, wspolczynniki_arch, wspolczyn_hold_arch i 4 bazy tekstowe: PlikiATArch, PlikiFIArch, PlikiMstArch i PlikiZgrArch. Aby uaktualnić bazy programu Giełda 2008, należy użyć Aktualizatora, który automatycznie pobierze wybrane przez nas bazy ze strony internetowej www.inwestkap.com/bazy.htm lub www.inwestkap.com.pl/bazy.htm i rozpakuje je do baz użytkownika. Należy pamiętać, że bazy są aktualizowane na stronie internetowej w każdą sobotę wieczorem.

Jeżeli będziemy chcieli uzupełnić brakujące notowania z kilku sesji bieżącego miesiąca wystarczy uruchomić Konwerter, który automatycznie ustawi datę pierwszej sesji do pobierania i pobierze wszystkie brakujące sesje po kliknięciu na przycisk Start. To czy potrzebne nam pliki są dostępne, możemy sprawdzić na stronie bossa.pl/pub/metastock/mstock/sesjaall.

Zaraz po instalacji programu należy uruchomić Aktualizatora i pobrać bazy archiwalne (Pliki ATArch, Pliki FIArch, Pliki MstArch, Pliki ZgrArch, notowania_arch5, wspolczynniki_arch i wspolczyn_hold_arch). Aby to nastąpiło musi być zaznaczona opcja Archiwalne oraz wszystkie opcje baz tekstowych i prawie wszystkie opcje baz notowań (bez Giełda). Jeśli inwestor posiada płytę z programem może bazy archiwalne przekopiować z płyty. Całą zawartość katalogu Bazy archiwalne znajdującego się na płycie należy przekopiować do katalogu Bazy (znajduje się na dysku twardym, tam gdzie zainstalowano program).

Aby zabezpieczyć się przed uszkodzeniami bazy danych wskazane jest robić kopie baz danych znajdujących się w katalogu Bazy.